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赛题名称:HuBMAP – Hacking the Human Vasculature 从人肾组织切片中分割微血管结构
赛题链接:https://www.kaggle.com/competitions/hubmap-hacking-the-human-vasculature
赛题背景
确定身体内全部 37 万亿个细胞的功能和关系是一项艰巨的任务。
目前绘制细胞图的努力涉及血管系统共同坐标框架 (VCCF),它使用人体中的血管系统作为主要导航系统。如果我们可以自动分割微脉管系统的排列,研究人员就可以使用真实世界的组织数据来开始填补这些空白并绘制出脉管系统。
赛题方向
计算机视觉、语义分割
赛题任务
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从肾组织切片中分割微血管结构
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基于健康人体肾组织2D PAS 染色组织学图像训练
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创建一个模型,帮助研究人员理解人体组织中血管排列方式
评价指标
通过计算置信度分数的平均精度来评估提交。
对于测试集中的每个图像,必须预测实例分割掩码及其关联的检测分数列表 (Confidence
)。该submission.csv
文件使用以下格式:
id,height,width,prediction_string
72e40acccadf,512,512,0 1.0 eNoLTDAwyrM3yI/PMwcAE94DZA==
数据描述
参赛者在本次比赛中的目标是定位人肾组织切片中的微血管结构(血管)。比赛数据包括从五个全幻灯片图像 (WSI) 中提取的磁贴,这些图像分为两个数据集。
数据集 1 中的图块具有经过专家审查的注释。数据集 2 包含来自这些相同 WSI 的剩余图块,并包含未经专家审查的稀疏注释。
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train|test/ 包含 TIFF 图像的文件夹。每个图块的大小为 512×512。
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tile_meta.csv每个图像的元数据。
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wsi_meta.csv从中提取图块的整个幻灯片图像的元数据。
时间安排
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2023 年 5 月 22 日- 开始报名
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2023 年 7 月 24 日- 报名截止日期
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2023 年 7 月 24 日- 团队合并截止日期
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2023 年 7 月 31 日- 最终提交截止日期。
竞赛奖金
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第一名 – 20,000 美元
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第二名 – 10,000 美元
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第三名 – 10,000 美元
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第四名 – 5,000 美元
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第五名 – 5,000 美元
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